Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms