Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms