Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms