Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms