Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim41Q5NCC3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms