Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm12253Q5NC48 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm12253Q5NC48 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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