Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1810065E05RikQ5NC41 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms