Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf3Q5HZG4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms