Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms