Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc2Q4U2R1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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