Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms