Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28bQ45KJ6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms