Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pydc3Q3V3Q4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms