Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk4Q3V129 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms