Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms