Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnpc3Q3UZ01 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms