Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dnaaf3Q3UYV8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms