Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fbQ3UWQ3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms