Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms