Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms