Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms