Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TceancQ3US16 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms