Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm20Q3UQS8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm20Q3UQS8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm20Q3UQS8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm20Q3UQS8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms