Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms