Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms