Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms