Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms