Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc106Q3ULM0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc106Q3ULM0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms