Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms