Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms