Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms