Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms