Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trafd1Q3UDK1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms