Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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