Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hvcn1Q3U2S8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms