Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec24aQ3U2P1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec24aQ3U2P1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms