Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kdm4dQ3U2K5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kdm4dQ3U2K5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kdm4dQ3U2K5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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