Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms