Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy4Q3TYX8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms