Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn4clQ3TYX2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lrrn4clQ3TYX2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms