Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms