Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms