Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms