Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp39Q3TIX9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms