Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms