Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem248Q3TBN1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms