Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms