Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl1Q2VPR5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms