Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp8Q2V6D6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp8Q2V6D6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp8Q2V6D6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp8Q2V6D6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp8Q2V6D6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp8Q2V6D6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp8Q2V6D6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp8Q2V6D6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp8Q2V6D6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms