Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpm1Q2TV84 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms